继续教育学院前身为山东中医药大学成人教育学院，担负学校的成人学历教育和继续教育工作，是学校的重要职能部门。学院内部机构设置齐全，下设教学管理科、学籍管理科、学生管理科、学院办公室四个科室。

　　山东中医药大学成人教育始于六十年代初，1960年开始举办夜（业）大学，1961年受省卫生厅委托创办中医函授大学。经国家教委批准，学校于1979年、1985年先后恢复了因“文革”而停办的夜（业）大学和函授大学，并于1985年创办教学辅导刊物《中医函授指南》。1992年开始举办多规格、多层次的继续教育培训班。经过四十多年的发展，已经形成较为完整的成人教育体系。目前学历层次有脱产、业余教育形式的专科、专升本科、高中起点本科、高职班及自学考试、短期培训、职业技能培训等。设中医、中药、护理、针灸推拿、中医养生康复、中药经营管理、中医骨伤学等7个专业。在全省设有曲阜、莱阳等6个函授站，菏泽、潍坊等10个教学点。现有在校生近6400余人。学院通过强化管理，完善制度，明确职责，注重效益，使成人教育的质量和水平不断提高，在省教育厅组织的教学评估中多次被评为“优秀”，2000年被评为山东省成人教育先进集体。为适应社会教育发展的需要，学校成人教育管理的职能部门成人教育学院于2001年更名为继续教育学院。“十五”期间，学校成人教育的主要发展目标是：稳定成人学历教育规模，改善专业结构和层次，积极发展继续教育，培养社会需要的高层次合格人才。